蛋白組學(xué)服務(wù)iTRAQ的4種同位素標(biāo)記試劑由４種相對分子質(zhì)量分別為114、115、116和117的報告基團(tuán)(reportergroup)，相對分子質(zhì)量分別為31、30、29和28的質(zhì)量平衡基團(tuán)(balancegroup)以及一個相同的肽反應(yīng)標(biāo)記試劑基團(tuán)(peptidereactivegroup)組成。不同的報告基團(tuán)分別與相應(yīng)的平衡基團(tuán)相配后，相對分子質(zhì)量均為145，即等量異位標(biāo)簽(isobarictag)。

　　將蛋白質(zhì)裂解為肽段，然后用iTRAQ試劑進(jìn)行差異標(biāo)記。由于iTRAQ試劑是等量的，即不同同位素在標(biāo)記同一多肽后在*級質(zhì)譜檢測，分子量相同，用串聯(lián)質(zhì)譜方法對在*級質(zhì)譜檢測到前體離子(precursorion)進(jìn)行碰撞誘導(dǎo)解離，產(chǎn)物離子通過第二級質(zhì)譜進(jìn)行分析。在二級質(zhì)譜分析過程中，報告基團(tuán)、質(zhì)量平衡基團(tuán)和多肽反應(yīng)基團(tuán)之間的鍵斷裂，質(zhì)量平衡基團(tuán)丟失，產(chǎn)生低質(zhì)荷比(m/z)的報告離子。由于二級質(zhì)譜可分析相對分子質(zhì)量相差1的報告基團(tuán)，不同報告基團(tuán)離子強(qiáng)度的差異就代表了它所標(biāo)記的多肽的相對豐度。同時，多肽內(nèi)的酰胺鍵斷裂，形成一系列b離子和y離子，得到離子片段的質(zhì)量數(shù)，通過數(shù)據(jù)庫查詢和比較，可以鑒定出相應(yīng)的蛋白質(zhì)前體.

　　蛋白組學(xué)服務(wù)的技術(shù)特點(diǎn)：

　　1、可同時標(biāo)記2~8個樣本。

　　2、iTRAQ技術(shù)不僅可發(fā)現(xiàn)胞漿蛋白，還有膜蛋白、核蛋白、胞外蛋白。iTRAQ技術(shù)可檢測出低豐度蛋白、強(qiáng)堿性蛋白、小于10KD或大于200KD的蛋白。

　　3、可標(biāo)記修飾后的氨基酸，因此對磷酸化蛋白等翻譯后修飾蛋白進(jìn)行定性定量研究。

　　4、報告離子的相對分子質(zhì)量較低(113~121)，低分子量區(qū)是質(zhì)譜定性(質(zhì)量確定)和定量(豐度比較)較為準(zhǔn)確的區(qū)域，因此質(zhì)譜檢測更為靈敏可靠。